Tuyến tỉnh: 03 bệnh viện đa khoa (Bệnh viện đa khoa tỉnh, Bệnh viện đa khoa khu vực Bồng Sơn, Bệnh viện đa khoa khu vực Phú Phong) với 1560 giường bệnh nội trú; 05 bệnh viện chuyên khoa (Bệnh viện Y học cổ truyền, Bệnh viện Tâm thần, Bệnh viện Lao và Bệnh phổi, Bệnh viện Mắt, Bệnh viện Điều dưỡng và Phục hồi chức năng) với 560 giường bệnh nội trú; 09 trung tâm chuyên ngành (Trung tâm Y tế dự phòng, Trung tâm phòng chống Sốt rét và các bệnh nội tiết, Trung tâm Chăm sóc sức khỏe sinh sản, Trung tâm phòng chống HIV/ADIS, Trung tâm Da liễu, Trung tâm Kiểm nghiệm Dược phẩm và Mỹ phẩm, Trung tâm Pháp y, Trung tâm Giám định y khoa, Trung tâm Truyền thông – Giáo dục sức khỏe).
Tuyến huyện, thị xã, thành phố: Có 11 Trung tâm y tế tại 11 huyện, thị xã, thành phố thuộc tỉnh (gồm 10 bệnh viện đa khoa với 1230 giường bệnh nội trú, 10 Đội Y tế dự phòng và 10 Đội Kế hoạch hóa gia đình); 11 Trung tâm Dân số - kế hoạch hóa gia đình.
Tuyến xã, phường, thị trấn (gọi chung là xã): gồm 159 trạm y tế và 1590 nhân viên y tế thôn, làng, khu vực (gọi chung là thôn) phủ khắp 1.133 thôn.
Các đơn vị y tế ngoài công lập: Gồm có 01 bệnh viện đa khoa (50 giường bệnh nội trú); 309 cơ sở hành nghề y; 445 cơ sở kinh doanh dược phẩm; 115 cơ sở y dược cổ truyền.
Các đơn vị y tế công lập thuộc Bộ và Ngành khác, gồm có: Bệnh viện Phong và Da liễu Trung ương Quy Hòa (thuộc Bộ Y tế); Viện Sốt rét - Ký sinh trùng - Côn trùng Quy Nhơn (thuộc Bộ Y tế); Bệnh viện Quân y 13 (thuộc Quân khu V - Bộ Quốc phòng); Bệnh viện Chỉnh hình và Phục hồi chức năng (thuộc Bộ Lao động Thương binh và Xã hội).